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生命医科学研究センター細胞機能変換技術研究チーム

チームリーダー鈴木治和（Ph.D.）

English Page

研究概要

遺伝子発現は転写制御ネットワークとDNAメチル化をはじめとするエピゲノムが複雑に相互作用することによって統合的に制御されています。我々は、特定の転写因子によるDNA脱メチル化誘導とその役割、DNAメチル化制御因子の異常を切り口とした疾患発症メカニズム、上皮間葉転換メカニズムと関連疾患、生殖細胞や上皮細胞の分化メカニズムなどの様々な方向からの研究を通じて、生命現象や関連疾患の理解や新たな技術の開発を達成し、また、疾患治療につながる研究を目指しています。

研究テーマ:

特定の転写因子によるDNA脱メチル化誘導とその役割
DNAメチル化制御因子の異常を切り口とした疾患発症メカニズム
上皮間葉転換メカニズムと関連疾患
生殖細胞・上皮細胞の分化とがん性形質転換メカニズム

研究主分野

総合生物

研究関連分野

生物学 & 生化学
分子生物 & 遺伝学

キーワード

トランスクリプトーム
転写制御ネットワーク
エピゲノム
バイオテクノロジー
ゲノム生物学

主要論文

1. Yoshida M, Kwon AT, Qin XY, Nishimura H, Maeda S, Miyamoto Y, Yoshida Y, Hoshino Y, Suzuki H.:
"Transcriptome analysis of long non-coding RNAs in Mycobacterium avium complex-infected macrophages"
Front Immunol, 15: 1374437 (2024).
2. Xu Y, Su T, Mishra H, Ando R, Furutani Y, Lu J, Cai M, Suzuki H, Yu W, Qin XY.:
"Corn Oligopeptide Alleviates Nonalcoholic Fatty Liver Disease by Regulating the Sirtuin Signaling Pathway"
J Agric Food Chem, 72(12): 6360-6371 (2024).
3. Qin XY, Shirakami Y, Honda M, Yeh SH, Numata K, Lai YY, Li CL, Wei F, Xu Y, Imai K, Takai K, Chuma M, Komatsu N, Furutani Y, Gailhouste L, Aikata H, Chayama K, Enomoto M, Tateishi R, Kawaguchi K, Yamashita T, Kaneko S, Nagaoka K, Tanaka M, Sasaki Y, Tanaka Y, Baba H, Miura K, Ochi S, Masaki T, Kojima S, Matsuura T, Shimizu M, Chen PJ, Moriwaki H, Suzuki H.:
"Serum MYCN as a predictive biomarker of prognosis and therapeutic response in the prevention of hepatocellular carcinoma recurrence"
Int J Cancer, doi: 10.1002/ijc.34893 (2024).
4. Qin XY, Furutani Y, Yonezawa K, Shimizu N, Kato-Murayama M, Shirouzu M, Xu Y, Yamano Y, Wada A, Gailhouste L, Shrestha R, Takahashi M, Keillor JW, Su T, Yu W, Fujii S, Kagechika H, Dohmae N, Shirakami Y, Shimizu M, Masaki T, Matsuura T, Suzuki H, Kojima S.:
"Targeting transglutaminase 2 mediated exostosin glycosyltransferase 1 signaling in liver cancer stem cells with acyclic retinoid"
Cell Death Dis, 14(6): 358 (2023).
5. Tanaka Y, Furuhata E, Maeda S, Kishima M, Suzuki H, Suzuki T.:
"A dataset of definitive endoderm and hepatocyte differentiations from human induced pluripotent stem cells"
Sci Data, 10(1): 93 (2023).
6. Yip CW, Hon CC, Yasuzawa K, Sivaraman DM, Ramilowski JA, Shibayama Y, Agrawal S, Prabhu AV, Parr C, Severin J, Lan YJ, Dostie J, Petri A, Nishiyori-Sueki H, Tagami M, Itoh M, Lopez-Redondo F, Kouno T, Chang JC, Luginbuhl J, Kato M, Murata M, Yip WH, Shu X, Abugessaisa I, Hasegawa A, Suzuki H, Kauppinen S, Yagi K, Okazaki Y, Kasukawa T, de Hoon M, Carninci P, Shin JW.:
"Antisense-oligonucleotide-mediated perturbation of long non-coding RNA reveals functional features in stem cells and across cell types."
Cell Rep, 41(13): 111893 (2022).
7. Suzuki T, Furuhata E, Maeda S, Kishima M, Miyajima Y, Tanaka Y, Lim J, Nishimura H, Nakanishi Y, Shojima A, Suzuki H.:
"GATA6 is predicted to regulate DNA methylation in an in vitro model of human hepatocyte differentiation"
Commun Biol, 5(1): 414 (2022).
8. Miyajima Y, Noguchi S, Tanaka Y, Li JR, Nishimura H, Kishima M, Lim J, Furuhata E, Suzuki T, Kasukawa T, Suzuki H.:
"Prediction of transcription factors associated with DNA demethylation during human cellular development"
Chromosome Res, 30(1): 109-121 (2022).
9. Yoshino T, Suzuki T, Nagamatsu G, Yabukami H, Ikegaya M, Kishima M, Kita H, Imamura T, Nakashima K, Nishinakamura R, Tachibana M, Inoue M, Shima Y, Morohashi KI, Hayashi K.:
"Generation of ovarian follicles from mouse pluripotent stem cells"
Science, 373(6552): eabe0237 (2021).
10. Suzuki T, Shimizu Y, Furuhata E, Maeda S, Kishima M, Nishimura H, Enomoto S, Hayashizaki Y, Suzuki H.:
"RUNX1 regulates site specificity of DNA demethylation by recruitment of DNA demethylation machineries in hematopoietic cells"
Blood Adv, 1(20): 1699-1711 (2017).